Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gli2Q0VGT2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli2Q0VGT2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms