Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp2b3Q0VF55 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms