Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab42Q0PD08 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms