Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Neurl1bQ0MW30 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Neurl1bQ0MW30 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Neurl1bQ0MW30 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Neurl1bQ0MW30 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms