Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms