Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms