Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21bQ0HA38 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms