Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms