Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm1Q0GA42 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms