Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate4Q09098 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms