Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms