Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms