Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GscQ02591 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GscQ02591 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GscQ02591 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GscQ02591 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GscQ02591 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GscQ02591 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GscQ02591 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GscQ02591 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GscQ02591 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GscQ02591 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GscQ02591 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GscQ02591 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GscQ02591 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GscQ02591 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GscQ02591 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GscQ02591 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GscQ02591 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GscQ02591 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GscQ02591 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GscQ02591 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms