Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms