Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Top2aQ01320 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms