Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms