Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Grin2bQ01097 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms