Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms