Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms