Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb4P99026 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms