Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frg1P97376 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg1P97376 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms