Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkp1P97350 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms