Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf1P84078 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arf1P84078 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms