Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux2P70298 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux2P70298 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux2P70298 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux2P70298 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux2P70298 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux2P70298 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux2P70298 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux2P70298 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms