Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chl1P70232 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chl1P70232 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chl1P70232 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chl1P70232 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chl1P70232 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms