Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DccP70211 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DccP70211 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DccP70211 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DccP70211 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DccP70211 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DccP70211 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DccP70211 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DccP70211 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DccP70211 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DccP70211 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DccP70211 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DccP70211 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DccP70211 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DccP70211 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DccP70211 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DccP70211 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DccP70211 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DccP70211 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DccP70211 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DccP70211 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DccP70211 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DccP70211 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DccP70211 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DccP70211 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DccP70211 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DccP70211 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DccP70211 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DccP70211 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DccP70211 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DccP70211 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DccP70211 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DccP70211 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DccP70211 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DccP70211 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DccP70211 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DccP70211 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DccP70211 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DccP70211 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
DccP70211 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DccP70211 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DccP70211 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DccP70211 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DccP70211 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DccP70211 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DccP70211 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DccP70211 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DccP70211 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DccP70211 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DccP70211 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DccP70211 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DccP70211 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DccP70211 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DccP70211 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DccP70211 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DccP70211 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DccP70211 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DccP70211 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DccP70211 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DccP70211 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DccP70211 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DccP70211 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DccP70211 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DccP70211 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DccP70211 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DccP70211 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DccP70211 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DccP70211 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DccP70211 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DccP70211 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DccP70211 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DccP70211 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DccP70211 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DccP70211 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms