Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig1P70193 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig1P70193 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms