Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc9P70170 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc9P70170 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Abcc9P70170 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms