Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd3P62320 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms