Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5r1P61809 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms