Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif4a1P60843 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif4a1P60843 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms