Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ythdf1P59326 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ythdf1P59326 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms