Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csrnp1P59054 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csrnp1P59054 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms