Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms