Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms