Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp3P57722 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms