Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lim2P56563 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lim2P56563 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms