Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd38P56528 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms