Protein–RNA interactions for Protein: P54276

Msh6, DNA mismatch repair protein Msh6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh6P54276 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh6P54276 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh6P54276 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh6P54276 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh6P54276 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh6P54276 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Msh6P54276 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh6P54276 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms