Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RabggtbP53612 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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