Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms