Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2e1P52482 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2e1P52482 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms