Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms