Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Defa-rs7P50715 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs7P50715 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms