Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pa2g4P50580 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pa2g4P50580 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms