Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc13P50207 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms