Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SrprbP47758 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrprbP47758 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrprbP47758 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrprbP47758 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrprbP47758 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms