Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax9P47242 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms