Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf5P43027 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms