Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbP41155 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtbP41155 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbP41155 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbP41155 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbP41155 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbP41155 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms